Les Cylons ont été créés pour servir les Hommes. Ils se sont rebellés, ont évolué, et peuvent désormais revêtir une apparence humaine. Ils ont un Plan. Il est simple : détruire purement et simplement la race qui les a réduits en esclavage. Mais lorsqu’une infime partie de l’Humanité réussit à survivre à leur attaque dévastatrice et décide de leur résister, ils n’ont pas d’autre choix que de s’adapter. Se déroulant juste après la destruction des Douze Colonies, l’intrigue suit les multiples versions des modèles Cylons Un et Six qui ont infiltré les humains survivants.